במצבים בהם יש צורך בהבנה מקיפה ורחבה יותר של קשיי הלומד, או כאשר יש צורך בהתאמות ברמה 3 כמו שאלון מותאם או בחינה בעל פה. מקרים נוספים בהם יש צורך באבחון פסיכודידקטי הם לקראת ועדת שילוב או ועדת השמה.

מטרתו של אבחון פסיכודידקטי היא לזהות את המקורות לקשיים הלימודיים ולבחון האם ישנה לקות למידה. האבחון מציע תכנית התערבות והתאמות לבחינות, במידת הצורך, בהתאם לממצאי האבחון. בנוסף, יינתנו המלצות להורים כמו גם ללומד עצמו.

אבחון פסיכודידקטי מתבצע על ידי מאבחן דידקטי מוסמך ופסיכולוג חינוכי מומחה.